Los Killis, salvo excepciones, viven en los medios acuáticos marginales, arroyos, charcas, fosas bordeando las carreteras, zonas inundadas por ríos, lluvias, o por el mar permanentemente o no. A veces viven en ecosistemas límite, como el caso del Ciprinodon diabolis que vive únicamente en el llamado "Hoyo del diablo" cavidad cárstica en Ash Meadows, desierto de Nevada, USA.
El caso de Lamprichthys tanganicanus es excepcional adaptándose a aguas libres pobladas de Cíclidos como los Tropheus, Julidochromis, Lamprologus, etc. Poseyendo una natación rapidísima y unas costumbres reproductoras que protegen la puesta, ya que esta es depositada en pequeñas grietas adoptando el huevo la forma de la grieta y adaptándose el embrión a esta deformación. En España, el Valencia hispánica vive en los nacimientos de agua cuyo curso antiguamente colonizaba, todo ello producido por la presión de nuevos competidores, como el cangrejo americano Procambarus clarkii o el gambusino Gambussia afinnis holbrocki. El recluirse al manantial también los proteje contra el uso de pesticidas en arrozales cercanos, lo cual brinda algo de esperanza para nuestras especies.
Son a menudo los únicos peces en estos biotopos (E.g. Austrolebias), y otras veces cohabitan con otros peces de otras familias, incluyendo predadores (Procatopus).
Muchas veces al ojo poco entrenado los hábitats de los Killis engañan. Así tendemos a pensar que en Africa ecuatorial los hábitats serán de aguas muy calientes. Y en algunos de los casos es así pero incluso sobre la línea del ecuador puede haber Killis que vivan en aguas frías, sobre todo si son zonas de montaña donde nacen los arroyos; estos pueden estar bajo una densa cubierta vegetal que provea de abundante sombra y por tanto se den las temperaturas más bajas. La alta humedad y su evaporación refrescan aún más las aguas. Es el caso de los Diapteron que requieren temperaturas de 19ºC para iniciar el desove, y en otras épocas del año vivan a 15ºC o menos. También hemos encontrado en zonas de agua fría, que un remanso estaba bañado por la luz solar. Casualmente era el único sitio donde pescamos A. exiguum. En las zonas de sombra abundaba A. cameronenese cameronense. Como caso extremo se sitúa el Aphanius dispar dispar que vive en aguas a 42 ºC en Somalia.
Igualmente una charca que conserve un árbol que la de sombra, puede constituirse en el único hábitat de una especie. A veces basta con talar ese árbol para hacer un poco de leña para extinguir una especie que no acepte la luz directa.
Otro caso de pobladores de aguas abiertas son los Orestias del Lago Titicaca. Este tiene unas dimensiones de 300 X 100 Km. Con frecuencia los Killis son considerados un buen alimento, así los Nothobranchius en algunas zonas de Africa son denominados "Anamolugo" que significa: "Fritos hacen un excelente plato".